第五十一幕　目覚める時は今・満身創痍の決着！

互いの剣技を駆使し激突する剣心と蒼紫。蒼紫は、闘いの最中に投げかけられる言葉の数々を聞き、かつての自分を取り戻していく。そして自身が“前”へ進むため、全力を尽くして最後の勝負に挑む。

脚本：菅 良幸　絵コンテ：工堂紘軌　演出：清水 明　作画監督：小林利充

第五十二幕　奇跡を呼び起こせ！葵屋の攻防

志々雄の十本刀たちの襲撃を受けた京都・葵屋では、激しい攻防が繰り広げられていた。葵屋を守ると剣心と約束した弥彦は、空中からの爆撃を得意とする飛翔の蝙也に、1人立ち向かっていく。

脚本：島田 満　絵コンテ：古橋一浩　演出：大町 繁　作画監督：松島 晃

第五十三幕　巨人対超人・絶望の淵に放たれた一矢！

轟音とともに突如出現した、破軍の才槌老人と不二。不二の桁外れの巨体と力を目のあたりにした葵屋の面々は、ただ圧倒される…。そんな葵屋の窮地に現れたのは、剣心の師匠・比古清十郎だった。

脚本：島田 満　絵コンテ：高倉一郎　演出：高倉一郎　作画監督：小林一幸

第五十四幕　飛天対縮地！宗次郎 　天賦の能力

新月村での決着をつけるべく、剣心の前に立ちはだかる十本刀の最後の1人・天剣の宗次郎。天賦の剣の才能に加え、神速をさらに超えた神速｢縮地｣を使う宗次郎に、剣心は背後を取られてしまう。

脚本：島田 満　絵コンテ：千明孝一　演出：千明孝一　作画監督：古橋一浩

第五十五幕　嵐の夜の惨劇・宗次郎の過去

｢強ければ生き、弱ければ死ぬ｣という志々雄に教えられた弱肉強食の理念で闘う宗次郎だが、剣心の｢不殺｣の信念に触れ動揺を覚える。そして心の奥底に封じ込めていた、幼き頃の惨劇を思い出す。

脚本：島田 満　絵コンテ：工堂紘軌　演出：清水 明　作画監督：小林利充

第五十六幕　極限の勝負！瞬天殺 対 天翔龍閃

幼き頃、生き残るために人を殺めた宗次郎。しかし、その心は今も後悔の念に震えていた…。貫いてきた理念と自分の心との矛盾に気がついた宗次郎は、自らを肯定するためにも剣心を倒そうとする。

脚本：島田 満　絵コンテ：古橋一浩　演出：大町 繁　作画監督：松島 晃

第五十七幕　幕末を駆けた二人・志々雄対剣心最終戦！

志々雄が待つ「大灼熱乃間」にたどり着いた剣心。日本の命運をかけた剣心と志々雄の最終決戦の幕がきって落とされた！満身創痍で剣心は果敢に攻めるが、志々雄の壱の秘剣「焔霊」が剣心を襲う!!

脚本：菅 良幸　絵コンテ：大関雅幸　演出：青木新一郎　作画監督：河村明夫

第五十八幕　時代は志々雄を選ぶのか？剣心最大の危機！

志々雄がとなえる「自然の摂理」という志々雄に、剣心は憤りを覚え、全身全霊をかけて抗う。だが志々雄の弐の秘剣「紅蓮腕」を受け、ついに剣心は倒れてしまう。そのとき突如、斎藤が現われ…!!

脚本：菅 良幸　絵コンテ：工堂紘軌　演出：吉村 章　作画監督：しんぼたくろう

第五十九幕　命運尽きず！闘志、今よみがえる

斎藤に続いて左之助も倒れ、志々雄の圧倒的な力の差を前に苦戦する蒼紫。そのとき蒼紫の背後で、強烈な剣気をまとって剣心は立ち上がった。極限状態を超えた剣心は神速の五連撃を志々雄に放つ!!

脚本：菅 良幸　絵コンテ：ちぎらこういち　演出：ちぎらこういち　作画監督：小林一幸

第六十幕　勝利を許されし者・志々雄対剣心終幕！

二人の剣客が雌雄を決する闘いの最終局面！剣心の「天翔龍閃」を受け、悶え苦しむ志々雄。志々雄を庇おうと、由美が間に割って入った一瞬の隙をついて、志々雄は由美ごと、剣心の身体を貫いた…。

脚本：菅 良幸　絵コンテ：古橋一浩　演出：古橋一浩　作画監督：千葉道徳